Mathematiker, Bioinformatiker - Datenanalyse, NGS (m/w/d) (Biologe/Biologin)

ARBEIT
Vollzeit
Mathematiker, Bioinformatiker - Datenanalyse, NGS (m/w/d) (Biologe/Biologin) in Ulm

Mathematiker, Bioinformatiker - Datenanalyse, NGS (m/w/d) (Biologe/Biologin) à Ulm, Deutschland

Emploi comme Biologe/Biologin à Ulm , Donau, Deutschland

Description du poste

 
Das Universitätsklinikum Ulm steht mit seinen Mitarbeitenden für eine moderne Patientenversorgung mit hoher Qualität, Spitzenforschung und eine auf die Zukunft ausgerichtete medizinische Lehre sowie Ausbildung in attraktiven Berufsfeldern. Voraussetzungen dafür sind qualifizierte und engagierte Mitarbeitende.

Wir suchen zum nächstmöglichen Zeitpunkt

wissenschaftliches Personal (w/m/d)

zur Mitarbeit in unserem Schwerpunkt Analyse und Sequenzierung von angeborenen Varianten des Immunsystems und des Hämatopoesesystems am Institut für Transfusionsmedizin.

Analyse von Exom- und Genomdatensätzen mit Schwerpunkt Immundefekte, Hämatopoesedefekte, Blutgruppen und mikrobielle Pathogene
Mitarbeit in der Betreuung des Geräteparks (z. B. Sangersequenzierung, Next-Generation-Sequencing (NGS), Third-Generation-Sequencing (TGS))
Einführung und Validierung neuer Analysesoftwarelösungen im Bereich NGS und TGS
Mitarbeit in Forschungsprojekten, beispielsweise der Entwicklung und Einführung neuer molekulargenetischer Methoden und bei der Betreuung von Auszubildenden und Studierenden
Mithilfe bei der Einführung von Deep Learning Tools
Mitarbeit an der Datenauswertung, Datenanalyse sowie der Ergebnispräsentation auf entsprechenden Kongressen und in Zeitschriften

Erfolgreich abgeschlossener Masterstudiengang mit Promotion im Bereich Mathematik, Biometrie, (Bio-)Informatik oder verwandte Studiengänge, Biologie, Molekulare Medizin, Pharmazeutische Biotechnologie, Bioinformatik, Medizin oder verwandte Studiengänge
Eigenhändige Erfahrung in der Sequenzierung eukaryotischer Gene, von der DNA-Isolation über die Sequenzierung bis hin zur Bewertung von Varianten (z. B. nach ACMG-Klassifikation)
Vorerfahrungen in der Auswertung genetischer Sequenzierdaten, idealerweise darunter auch exom- bzw. genomweite Analysen
Deutsch- und Englischkenntnisse, mindestens C1
Neugier, insbesondere, neue Technologien zu evaluieren und anzuwenden
Flexibilität sowie Teamfähigkeit
Freude an verantwortungsbewusstem und selbstständigem Arbeiten

Eine interessante, sinnstiftende Tätigkeit verbunden mit der Möglichkeit, Grundlagen- und Anwendungsforschung zu kombinieren
Mitarbeit in einem breit aufgestellten, gemischten Team aus Ärzten (m/w/d), Wissenschaftlern (m/w/d), Technischen Assistenten (m/w/d) und Studierenden
Räumlich und technisch hochwertig ausgestattete Labore mit breitem Methodenspektrum (u. A. Third-Generation Sequencing, FACS, CRISPR/Cas9, IPSC-Modelle, Live-cell imaging, WB, ELISA, PCR/qPCR, etc.)
Hochmoderner Gerätepark, inklusive Third-Generation-Sequencing
Einen Arbeitsplatz in einem krisensicheren Unternehmen der Gesundheits- und Sozialwirtschaft
Abwechslungsreiche, eigenverantwortliche Arbeit in einem fachlich kompetenten und engagierten Team
Bezahlung nach TV-L sowie betriebliche Altersvorsorge
Unterstützung bei der Vereinbarkeit von Beruf und Familie
Vielfältige Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten sowie betriebliche Gesundheitsförderung
Personalwohnheim
Jobticket und rabattiertes Deutschlandticket

Die Stelle ist zunächst auf vier Jahre befristet mit der Option auf Verlängerung. Eine daran anschließende Beschäftigung wird angestrebt. Das Forschungsprojekt ist angesiedelt am Institut für Transfusionsmedizin des Universitätsklinikums Ulm (Direktor: Prof. Dr. H. Schrezenmeier) in Zusammenarbeit mit dem Institut für Klinische Transfusionsmedizin und Immungenetik Ulm gemeinnützige GmbH (Gemeinschaftsunternehmen des DRK-Blutspendedienstes Baden-Württemberg | Hessen gemeinnützige GmbH und des Universitätsklinikums Ulm AöR).
Der Einsatz erfolgt in der Abteilung Molekulare Diagnostik, Molekulare Therapie und Experimentelle Transplantation (Leiter: PD Dr. D. Messerer).
Europa.eu

Europa.eu

Vollzeit
Donau
Deutschland

Date de début

2024-05-18

Universitätsklinikum Ulm

Albert-Einstein-Allee 29

89081

oeckllab.com"

Universitätsklinikum Ulm
Publié:
2024-05-18
UID | BB-6648c4e9bdedf-6648c4e9bdee1
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ARBEIT

Biologe/Biologin

24.01/2025 – Sachbearbeiter im Bereich Naturschutz (w/m/d) (50 %) (Biologe/Biologin)

Ulm


24.01/2025 – Sachbearbeiter im Bereich Naturschutz (w/m/d) (50 %)

für unseren Fachdienst Forst, Naturschutz

Landschaftspflege und andere Naturschutzaufgaben sind bei Ihnen in guten Händen.

Als untere Naturschutzbehörde sind wir zuständig für eine einzigartige Landschaft zwischen dem fruchtbaren Donautal und den Wäldern und Wacholderheiden der Schwäbischen Alb. Wir sind Ansprechpartner für 55 Städte und Gemeinden mit rund 200.000 Einwohnern für alle Themen rund um Naturschutz und Landschaftspflege.


Die Stelle soll zum nächstmöglichen Zeitpunkt, zunächst befristet für 2 Jahre besetzt

werden.

Ihre Aufgaben bei uns:

·         Sie bearbeiten Förderanträge nach der Landschaftspflegerichtlinie in verwaltungstechnischer und fachlicher Hinsicht.

·         Sie arbeiten eng mit dem Landschaftserhaltungsverband und der Landwirtschaftsbehörde zusammen.

·         Sie beraten Flächeneigentümer, Bewirtschaftende und Kommunen in Fragen der Biotop- und Landschaftspflege, ein Schwerpunkt liegt dabei auf der Erhaltung von FFH-Mähwiesen.

·         Sie bearbeiten Verfahren nach der Ökokontoverordnung.  

·         Sie unterstützen bei Bedarf die Gebietsfachkräfte der unteren Naturschutzbehörde in deren Aufgabenbereichen (u. a. Stellungnahmen zu verschiedenen Verfahren, Prüfen von Fachgutachten, Wahrnehmung von Ortsterminen).

Änderungen des Aufgabengebietes behalten wir uns vor.

Das bringen Sie mit:

·       Sie haben ein abgeschlossenes Bachelorstudium in den Fachrichtungen Biologie, Landschaftsplanung oder Geographie mit Schwerpunkt Naturschutz, oder verfügen über eine vergleichbare Qualifikation.

·       Sie haben gute Kenntnisse über die heimische Flora und Fauna und können selbst vegetationskundliche Einschätzungen vornehmen.  

·       Die Förderung nach der Landschaftspflegerichtlinie ist Ihnen bekannt. Sie bringen möglichst Erfahrungen aus der öffentlichen oder privaten Verwaltung mit.  

·       Verhandlungsgeschick, Beratungskompetenz und eine sichere Entscheidungsfähigkeit gehören zu Ihren Stärken.

·       Sie arbeiten eigenverantwortlich und zuverlässig, schätzen aber ebenso den wertvollen Austausch und die Zusammenarbeit im Team.

·       Auch in herausfordernden Situationen bleiben Sie belastbar, flexibel und behalten einen kühlen Kopf.

·       Der Umgang mit den gängigen MS Office-Anwendungen ist für Sie selbstverständlich, darüber hinaus haben Sie gute Kenntnisse in der Anwendung von Geoinformationssystemen und sind bereit sich in Fachanwendungen einzuarbeiten (u. a. Landschaftspflegeinformationssystem).

·       Sie haben eine Fahrerlaubnis der Klasse B und idealerweise die Bereitschaft, bei Bedarf auch ein privates Fahrzeug für Außendiensttermine einzusetzen. In der Regel sind Dienstfahrzeuge verfügbar.

Darauf können Sie sich freuen:

·       Eine attraktive Vergütung in der Entgeltgruppe 11 TVöD.

·       Eine sinnstiftende Tätigkeit, die Ihnen Einblicke in vielfältige Aufgabenbereiche bietet und Abwechslung in Ihren Arbeitsalltag bringt.

·       Eine gründliche und praxisnahe Einarbeitung, bei der Sie von einem kollegialen und unterstützenden Team begleitet werden, das Wert auf ein wertschätzendes Miteinander legt.

·       Vielfältige Möglichkeiten zur fachlichen und persönlichen Weiterentwicklung, inklusive eines Nachwuchsführungskräfteprogramms, das Ihre Karrierechancen erweitert.

·       Flexible Arbeitszeiten, die es Ihnen ermöglichen, Ihre Arbeit und Ihr Privatleben optimal zu gestalten – dazu bieten wir auch die Möglichkeit von Telearbeit oder mobilem Arbeiten, soweit es der Dienst erlaubt.

·       Attraktive Benefits wie ein Zuschuss zum Fahrradkauf, exklusive Mitarbeitervorteile über das Portal Corporate Benefits und regelmäßige Mitarbeiterveranstaltungen.

·       Ein betriebliches Gesundheitsmanagement, das Ihnen dabei hilft, fit und gesund zu bleiben.

·       Einen monatlichen Zuschuss von derzeit bis 44 € für das DING-Jobticket oder das Deutschlandticket, um Ihre Mobilität zu unterstützen.

·       Eine betriebliche Zusatzversicherung zur Rente (ZVK Rente), die bereits jetzt für Ihre Zukunft vorsorgt.

Die Vereinbarkeit von Familie und Beruf ist uns ein wichtiges Anliegen. Deshalb setzen wir alles daran, in jeder Lebenslage gemeinsam mit unseren Mitarbeiterinnen und Mitarbeitern individuelle Lösungen zu finden, die ein ausgewogenes Verhältnis zwischen den Bedürfnissen der Familie und den Anforderungen des Arbeitsalltags ermöglichen.

Haben wir Ihr Interesse geweckt?

Dann freuen wir uns auf Ihre Bewerbung bis zum 21. März 2025.

Wenn Sie vorher mit uns sprechen möchten, rufen Sie uns gerne an.

Ihre Fragen beantwortet:
Swinde Börsig, Fachdienst Forst, Naturschutz – 0731 185-1281.

Frau Edelgard Rommel, Fachdienst Personal – 0731 185-1212.

Landratsamt Alb-Donau-Kreis, Fachdienst Personal, Schillerstraße 30 in 89077 Ulm.


Ergänzende Informationen:
Nur schwerbehinderte oder ihnen gleichgestellte Personen

Landratsamt Alb-Donau-Kreis Fachdienst Personal

Landratsamt Alb-Donau-Kreis Fachdienst Personal
2025-02-28
ARBEIT

Biologe/Biologin

Biologin / Biologe im Bereich Experimentelle Forschung (m/w/d) (Biologe/Biologin)

Ulm


Unternehmen:

Bundeswehr - Mach, was wirklich zählt.

BESCHÄFTIGUNGSDIENSTSTELLE

Bundeswehrkrankenhaus Ulm

Stellenbeschreibung:

- Die Stellenbeschreibung wurde gekürzt: Die vollständige Beschreibung inklusive Bewerbungsprozess finden Sie am Ende unter "Information zur Bewerbung (Internetseite des Arbeitgebers)".
- Sie entwickeln, etablieren und bauen den Forschungsbereich #Grundlegende und experimentelle Traumaforschung# auf und leiten diesen Bereich.
- Sie befassen sich schwerpunktmäßig mit Forschungsaktivitäten zu Fragen der molekularen und zellulären Traumaantwort sowie der Wundheilung und Geweberegeneration. Die experimentellen Arbeiten sollen sich auf biotechnologische (gewebebasierte und in-vitro) Untersuchungen (Histologie, Immunhistologie, DNA-/RNA-/Proteinanalytik, Zellkultur) und moderne Tierversuchsersatzmodelle nach dem 3R-Prinzip (z.B. chick embryo chorioallantoic membrane-Modell) stützen.
- Sie bauen eine Forschungsgruppe aus wissenschaftlichen und nichtwissenschaftlichen Mitarbeitenden auf.
- Sie wirken aktiv mit bei der Einwerbung kompetitiver Drittmittel (EU, DFG, BMBF, etc.)
- Sie entwickeln, betreuen und leiten translationale Forschungsvorhaben.
- Sie bauen langfristige Kooperationen mit den klinischen Abteilungen des Bundeswehrkrankenhauses Ulm, dem Universitätsklinikum Ulm und den Forschungseinrichtungen der Universität Ulm (inkl. Multidimensionale Trauma-Wissenschaften) sowie weiteren Einrichtungen auf nationaler und internationaler Ebene auf.
- Sie beteiligen sich mit an der Planung und Durchführung wissenschaftlicher Lehrveranstaltungen (z.B. Habilitandinnen- und Habilitanden-Panel, Doktorandinnen- und Doktorandenseminar).
- Sie betreuen medizinische Doktorandinnen und Doktoranden sowie PhD-Studierende bei der aktiven Labortätigkeit in Abstimmung mit PostDocs und Projektverantwortlichen.
- Die Teilnahme an regelmäßigen und weiterführenden Aus- und Fortbildungen wird vorausgesetzt.
WAS FÜR SIE ZÄHLT
- Sie werden in ein unbefristetes Arbeitsverhältnis eingestellt.
- Die ausgeschriebene Stelle ist mit der Besoldungsgruppe A13/A14 Bundesbesoldungsgesetz (BBesG) bewertet.
- Sie erwartet ein attraktives Gehalt.
- Eine Eingruppierung erfolgt bis in die Entgeltgruppe 13 Tarifvertrag für den öffentlichen Dienst (TVöD).
- Sie arbeiten in Vollzeit oder Teilzeit. Homeoffice ist möglich.
- Sie haben die Möglichkeit, in einem festgelegten Rahmen an Sport- und Gesundheitsprogrammen während der Arbeitszeit teilzunehmen.
- Es besteht die Möglichkeit zur weiterführenden wissenschaftlichen Qualifikation (Habilitation).
- Eine spätere Übernahme in das Beamtenverhältnis ist bei Erfüllung der hierfür notwendigen Voraussetzungen grundsätzlich möglich.

Qualifikationserfordernisse:

WAS FÜR UNS ZÄHLT

- Sie verfügen über einen erfolgreich abgeschlossenen Master- oder Universitätsdiplomstudiengang der Fachrichtung Biologie, Mikrobiologie, Biotechnologie oder vergleichbar.
- Sie verfügen über Kenntnisse und Erfahrungen in Zellbiologie, Molekularbiologie, Tierstudien bzw. Tierversuchsersatzmodellen, DNA/RNA-Analytik und Proteinbiochemie, nachgewiesen durch mindestens eine berufliche Tätigkeit.
- Sie verfügen über Kenntnisse und Erfahrungen in der interdisziplinären und interprofessionellen Forschung, zum Beispiel mit dem Schwerpunkt Traumaforschung an Knochen- und Muskelgewebe, nachgewiesen durch mindestens eine berufliche Tätigkeit.
- Sie besitzen die deutsche Staatsbürgerschaft.
- Sie bekennen sich durch Ihr gesamtes Verhalten zur freiheitlich demokratischen Grundordnung im Sinne des Grundgesetzes und treten für deren Einhaltung ein.
- Sie stimmen zu, an einer gesundheitlichen Eignungsfeststellung teilzunehmen.
- Sie erfüllen die Vorgaben des Gesetzes für den Schutz vor Masern und zur Stärkung der Impfprävention (Masernschutzgesetz).
- Für die Einstellung gibt es keine Altersgrenze, aber im Hinblick auf eine mögliche Verbeamtung dürfen Sie zum Zeitpunkt der Ernennung grundsätzlich das 50. Lebensjahr noch nicht vollendet haben.
ERWÜNSCHT
- Sie verfügen über Kenntnisse und Erfahrungen im Einsatz von Tierversuchsersatzmodellen nach dem 3R-Prinzip (z.B. chick embryo chorioallantoic membrane-Modell), nachgewiesen durch mindestens eine berufliche Tätigkeit.

Ergänzende Informationen:

BEWERBUNG & KONTAKT

Registrieren Sie sich auf unserem Bewerbungsportal unter https://bewerbung.bundeswehr-karriere.de und betätigen Sie den Button "Karriere starten" unten rechts. Ihre Bewerbungsunterlagen laden Sie bitte als PDF-Druckversion bis spätestens 02.01.2025 in Ihr Bewerberprofil hoch.

Ihre Bewerbung umfasst:

- Anschreiben
- Lebenslauf (tabellarisch)
- Abschlusszeugnisse
und sofern vorhanden:
- Nachweise bzw. Arbeitszeugnisse bisheriger Arbeitgeber
- Gegebenenfalls senden Sie uns bitte eine Kopie des Schwerbehindertenausweises oder des Bescheides über die Gleichstellung als schwerbehinderter Mensch unter Angaben des Referenzcodes / der ID an die E-Mail-Adresse [email protected] zu.
Zusätzlich erforderlich:
- Bei fremdsprachigen Bewerbungsunterlagen muss eine beglaubigte deutsche Übersetzung beigefügt werden.
- Bei ausländischen Bildungsabschlüssen ist ein Nachweis der Anerkennung in Deutschland beizufügen.
Für weitere Informationen wenden Sie sich bitte an das:

Bundesamt für das Personalmanagement der Bundeswehr
Abteilung V
Referat 2.2.1

02241 / 15 2727 (Herr Dahms)

Bei konkreten Fragen zur Fachlichkeit wenden Sie sich bitte an das:

Bundeswehrkrankenhaus Ulm

Klinischer Direktor Pathologie

0731 / 1710 2401 (Herr Prof. Dr. Dr. Steinestel)

Bundesamt für das Personalmanagement der Bundeswehr Abteilung V

Bundesamt für das Personalmanagement der Bundeswehr Abteilung V Logo
2024-12-04
ARBEIT

Biologe/Biologin

PhD Student Biochemistry - Biomarker Development (m/f/d) (Biologe/Biologin)

Ulm


The University Hospital Ulm with its employees (f/m/d) stands for modern patient care with high quality, top research and medical teaching oriented towards the future as well as training in attractive professional fields. The prerequisites for this are qualified and committed employee.

The department of Neurology of the University Medical Center Ulm (Acting Medical Director: Professor Dr. G. Landwehrmeyer) is instantly offering a

Ph.D student position

in Biomarker Research for Neurodegenerative Diseases in the laboratory of Dr. Öckl.

The Öckl lab at the Department of Neurology focuses on the discovery, validation and implementation of fluid biomarkers (CSF, blood) for neurodegenerative diseases inlcuding amyotrophic lateral sclerosis (ALS), Alzheimer´s disease, Parkinson´s disease and frontotemporal dementia to enable and improve early and differential diagnosis, prognosis, disease staging and monitoring of treatment effects. We use a comprehensive toolbox of methods with different types of immunoassays (ELISA, Simoa, Ella) and also mass spectrometry for the development of novel biomarker assays and the study of established biomarkers such as NfL, GFAP or pTau in different biological samples. We are equipped with state-of-the-art technology and have good access to well-characterized CSF/blood samples from patients with different neurological diseases via the biobank of the Department of Neurology. The Oeckl lab is also associated to the German Center for Neurodegenerative Diseases (DZNE) Ulm providing an excellent research infrastructure.

Development and use of established immuno- (ELISA, Simoa, Ella) and activity assays for biomarkers in CSF and blood; i.e. active participation in experimental work, experimental design, data generation, data analysis and interpretation
Study of biomarker changes in patient samples of different neurodegenerative diseases especially amyotrophic lateral sclerosis
Presentation of results at progress report meetings and international conferences
Prepare and write manuscripts for publication in international scientific journals

Master Degree in biochemistry, biology, molecular medicine, pharmacology or equivalent
Strong background and understanding of protein biochemistry
Excellent experimental and analytical skills and interest in assay development
High interest in neurodegenerative diseases; experience in neurosciences is advantageous
Team-oriented, independent and ambitious working style

Highly interesting up-to-date and clinically relevant research questions in a dynamic team
State-of-the art instrumentation like Simoa, Ella, Exploris and competitive research infrastructure including the association to the German Center for Neurodegenerative Diseases (DZNE, www.oeckllab.com)
Payment according to TV-L (Baden Württemberg) and pension plan provided by your employer
Support for pursuing a career with a work-family balance
A variety of training programs that promote professional development
Work place health promotion
Various opportunities for recreational activities in the Ulm area

Universitätsklinikum Ulm

Universitätsklinikum Ulm
2024-05-27
ARBEIT
Vollzeit

Biologe/Biologin

PhD Student Biochemistry - Biomarker Development (m/f/d) (Biologe/Biologin)

Ulm


The University Hospital Ulm with its employees (f/m/d) stands for modern patient care with high quality, top research and medical teaching oriented towards the future as well as training in attractive professional fields. The prerequisites for this are qualified and committed employee.

The department of Neurology of the University Medical Center Ulm (Acting Medical Director: Professor Dr. G. Landwehrmeyer) is instantly offering a

Ph.D student position

in Biomarker Research for Neurodegenerative Diseases in the laboratory of Dr. Öckl.

The Öckl lab at the Department of Neurology focuses on the discovery, validation and implementation of fluid biomarkers (CSF, blood) for neurodegenerative diseases inlcuding amyotrophic lateral sclerosis (ALS), Alzheimer´s disease, Parkinson´s disease and frontotemporal dementia to enable and improve early and differential diagnosis, prognosis, disease staging and monitoring of treatment effects. We use a comprehensive toolbox of methods with different types of immunoassays (ELISA, Simoa, Ella) and also mass spectrometry for the development of novel biomarker assays and the study of established biomarkers such as NfL, GFAP or pTau in different biological samples. We are equipped with state-of-the-art technology and have good access to well-characterized CSF/blood samples from patients with different neurological diseases via the biobank of the Department of Neurology. The Oeckl lab is also associated to the German Center for Neurodegenerative Diseases (DZNE) Ulm providing an excellent research infrastructure.

Development and use of established immuno- (ELISA, Simoa, Ella) and activity assays for biomarkers in CSF and blood; i.e. active participation in experimental work, experimental design, data generation, data analysis and interpretation
Study of biomarker changes in patient samples of different neurodegenerative diseases especially amyotrophic lateral sclerosis
Presentation of results at progress report meetings and international conferences
Prepare and write manuscripts for publication in international scientific journals

Master Degree in biochemistry, biology, molecular medicine, pharmacology or equivalent
Strong background and understanding of protein biochemistry
Excellent experimental and analytical skills and interest in assay development
High interest in neurodegenerative diseases; experience in neurosciences is advantageous
Team-oriented, independent and ambitious working style

Highly interesting up-to-date and clinically relevant research questions in a dynamic team
State-of-the art instrumentation like Simoa, Ella, Exploris and competitive research infrastructure including the association to the German Center for Neurodegenerative Diseases (DZNE, www.oeckllab.com)
Payment according to TV-L (Baden Württemberg) and pension plan provided by your employer
Support for pursuing a career with a work-family balance
A variety of training programs that promote professional development
Work place health promotion
Various opportunities for recreational activities in the Ulm area

Universitätsklinikum Ulm

Universitätsklinikum Ulm
2024-05-25
ARBEIT
Vollzeit

Biologe/Biologin

PhD Student Biochemistry - Biomarker Development (m/f/d) (Biologe/Biologin)

Ulm


The University Hospital Ulm with its employees (f/m/d) stands for modern patient care with high quality, top research and medical teaching oriented towards the future as well as training in attractive professional fields. The prerequisites for this are qualified and committed employee.

The department of Neurology of the University Medical Center Ulm (Acting Medical Director: Professor Dr. G. Landwehrmeyer) is instantly offering a

Ph.D student position

in Biomarker Research for Neurodegenerative Diseases in the laboratory of Dr. Öckl.

The Öckl lab at the Department of Neurology focuses on the discovery, validation and implementation of fluid biomarkers (CSF, blood) for neurodegenerative diseases inlcuding amyotrophic lateral sclerosis (ALS), Alzheimer´s disease, Parkinson´s disease and frontotemporal dementia to enable and improve early and differential diagnosis, prognosis, disease staging and monitoring of treatment effects. We use a comprehensive toolbox of methods with different types of immunoassays (ELISA, Simoa, Ella) and also mass spectrometry for the development of novel biomarker assays and the study of established biomarkers such as NfL, GFAP or pTau in different biological samples. We are equipped with state-of-the-art technology and have good access to well-characterized CSF/blood samples from patients with different neurological diseases via the biobank of the Department of Neurology. The Oeckl lab is also associated to the German Center for Neurodegenerative Diseases (DZNE) Ulm providing an excellent research infrastructure.

Development and use of established immuno- (ELISA, Simoa, Ella) and activity assays for biomarkers in CSF and blood; i.e. active participation in experimental work, experimental design, data generation, data analysis and interpretation
Study of biomarker changes in patient samples of different neurodegenerative diseases especially amyotrophic lateral sclerosis
Presentation of results at progress report meetings and international conferences
Prepare and write manuscripts for publication in international scientific journals

Master Degree in biochemistry, biology, molecular medicine, pharmacology or equivalent
Strong background and understanding of protein biochemistry
Excellent experimental and analytical skills and interest in assay development
High interest in neurodegenerative diseases; experience in neurosciences is advantageous
Team-oriented, independent and ambitious working style

Highly interesting up-to-date and clinically relevant research questions in a dynamic team
State-of-the art instrumentation like Simoa, Ella, Exploris and competitive research infrastructure including the association to the German Center for Neurodegenerative Diseases (DZNE, www.oeckllab.com)
Payment according to TV-L (Baden Württemberg) and pension plan provided by your employer
Support for pursuing a career with a work-family balance
A variety of training programs that promote professional development
Work place health promotion
Various opportunities for recreational activities in the Ulm area

Universitätsklinikum Ulm

Universitätsklinikum Ulm
2024-05-18
ARBEIT
Vollzeit

Biologe/Biologin

Mathematiker, Bioinformatiker - Datenanalyse, NGS (m/w/d) (Biologe/Biologin)

Ulm


Das Universitätsklinikum Ulm steht mit seinen Mitarbeitenden für eine moderne Patientenversorgung mit hoher Qualität, Spitzenforschung und eine auf die Zukunft ausgerichtete medizinische Lehre sowie Ausbildung in attraktiven Berufsfeldern. Voraussetzungen dafür sind qualifizierte und engagierte Mitarbeitende.

Wir suchen zum nächstmöglichen Zeitpunkt

wissenschaftliches Personal (w/m/d)

zur Mitarbeit in unserem Schwerpunkt Analyse und Sequenzierung von angeborenen Varianten des Immunsystems und des Hämatopoesesystems am Institut für Transfusionsmedizin.

Analyse von Exom- und Genomdatensätzen mit Schwerpunkt Immundefekte, Hämatopoesedefekte, Blutgruppen und mikrobielle Pathogene
Mitarbeit in der Betreuung des Geräteparks (z. B. Sangersequenzierung, Next-Generation-Sequencing (NGS), Third-Generation-Sequencing (TGS))
Einführung und Validierung neuer Analysesoftwarelösungen im Bereich NGS und TGS
Mitarbeit in Forschungsprojekten, beispielsweise der Entwicklung und Einführung neuer molekulargenetischer Methoden und bei der Betreuung von Auszubildenden und Studierenden
Mithilfe bei der Einführung von Deep Learning Tools
Mitarbeit an der Datenauswertung, Datenanalyse sowie der Ergebnispräsentation auf entsprechenden Kongressen und in Zeitschriften

Erfolgreich abgeschlossener Masterstudiengang mit Promotion im Bereich Mathematik, Biometrie, (Bio-)Informatik oder verwandte Studiengänge, Biologie, Molekulare Medizin, Pharmazeutische Biotechnologie, Bioinformatik, Medizin oder verwandte Studiengänge
Eigenhändige Erfahrung in der Sequenzierung eukaryotischer Gene, von der DNA-Isolation über die Sequenzierung bis hin zur Bewertung von Varianten (z. B. nach ACMG-Klassifikation)
Vorerfahrungen in der Auswertung genetischer Sequenzierdaten, idealerweise darunter auch exom- bzw. genomweite Analysen
Deutsch- und Englischkenntnisse, mindestens C1
Neugier, insbesondere, neue Technologien zu evaluieren und anzuwenden
Flexibilität sowie Teamfähigkeit
Freude an verantwortungsbewusstem und selbstständigem Arbeiten

Eine interessante, sinnstiftende Tätigkeit verbunden mit der Möglichkeit, Grundlagen- und Anwendungsforschung zu kombinieren
Mitarbeit in einem breit aufgestellten, gemischten Team aus Ärzten (m/w/d), Wissenschaftlern (m/w/d), Technischen Assistenten (m/w/d) und Studierenden
Räumlich und technisch hochwertig ausgestattete Labore mit breitem Methodenspektrum (u. A. Third-Generation Sequencing, FACS, CRISPR/Cas9, IPSC-Modelle, Live-cell imaging, WB, ELISA, PCR/qPCR, etc.)
Hochmoderner Gerätepark, inklusive Third-Generation-Sequencing
Einen Arbeitsplatz in einem krisensicheren Unternehmen der Gesundheits- und Sozialwirtschaft
Abwechslungsreiche, eigenverantwortliche Arbeit in einem fachlich kompetenten und engagierten Team
Bezahlung nach TV-L sowie betriebliche Altersvorsorge
Unterstützung bei der Vereinbarkeit von Beruf und Familie
Vielfältige Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten sowie betriebliche Gesundheitsförderung
Personalwohnheim
Jobticket und rabattiertes Deutschlandticket

Die Stelle ist zunächst auf vier Jahre befristet mit der Option auf Verlängerung. Eine daran anschließende Beschäftigung wird angestrebt. Das Forschungsprojekt ist angesiedelt am Institut für Transfusionsmedizin des Universitätsklinikums Ulm (Direktor: Prof. Dr. H. Schrezenmeier) in Zusammenarbeit mit dem Institut für Klinische Transfusionsmedizin und Immungenetik Ulm gemeinnützige GmbH (Gemeinschaftsunternehmen des DRK-Blutspendedienstes Baden-Württemberg | Hessen gemeinnützige GmbH und des Universitätsklinikums Ulm AöR).
Der Einsatz erfolgt in der Abteilung Molekulare Diagnostik, Molekulare Therapie und Experimentelle Transplantation (Leiter: PD Dr. D. Messerer).

Universitätsklinikum Ulm

Universitätsklinikum Ulm
2024-05-18
ARBEIT
Vollzeit

Biologe/Biologin

PhD Student Biochemistry - Biomarker Development (m/f/d) (Biologe/Biologin)

Ulm


The University Hospital Ulm with its employees (f/m/d) stands for modern patient care with high quality, top research and medical teaching oriented towards the future as well as training in attractive professional fields. The prerequisites for this are qualified and committed employee.

The department of Neurology of the University Medical Center Ulm (Acting Medical Director: Professor Dr. G. Landwehrmeyer) is instantly offering a

Ph.D student position

in Biomarker Research for Neurodegenerative Diseases in the laboratory of Dr. Öckl.

The Öckl lab at the Department of Neurology focuses on the discovery, validation and implementation of fluid biomarkers (CSF, blood) for neurodegenerative diseases inlcuding amyotrophic lateral sclerosis (ALS), Alzheimer´s disease, Parkinson´s disease and frontotemporal dementia to enable and improve early and differential diagnosis, prognosis, disease staging and monitoring of treatment effects. We use a comprehensive toolbox of methods with different types of immunoassays (ELISA, Simoa, Ella) and also mass spectrometry for the development of novel biomarker assays and the study of established biomarkers such as NfL, GFAP or pTau in different biological samples. We are equipped with state-of-the-art technology and have good access to well-characterized CSF/blood samples from patients with different neurological diseases via the biobank of the Department of Neurology. The Oeckl lab is also associated to the German Center for Neurodegenerative Diseases (DZNE) Ulm providing an excellent research infrastructure.

Development and use of established immuno- (ELISA, Simoa, Ella) and activity assays for biomarkers in CSF and blood; i.e. active participation in experimental work, experimental design, data generation, data analysis and interpretation
Study of biomarker changes in patient samples of different neurodegenerative diseases especially amyotrophic lateral sclerosis
Presentation of results at progress report meetings and international conferences
Prepare and write manuscripts for publication in international scientific journals

Master Degree in biochemistry, biology, molecular medicine, pharmacology or equivalent
Strong background and understanding of protein biochemistry
Excellent experimental and analytical skills and interest in assay development
High interest in neurodegenerative diseases; experience in neurosciences is advantageous
Team-oriented, independent and ambitious working style

Highly interesting up-to-date and clinically relevant research questions in a dynamic team
State-of-the art instrumentation like Simoa, Ella, Exploris and competitive research infrastructure including the association to the German Center for Neurodegenerative Diseases (DZNE, www.oeckllab.com)
Payment according to TV-L (Baden Württemberg) and pension plan provided by your employer
Support for pursuing a career with a work-family balance
A variety of training programs that promote professional development
Work place health promotion
Various opportunities for recreational activities in the Ulm area

Universitätsklinikum Ulm

Universitätsklinikum Ulm
2024-05-05
ARBEIT
Vollzeit

Biologe/Biologin

Mathematiker, Bioinformatiker - Datenanalyse, NGS (m/w/d) (Biologe/Biologin)

Ulm


Das Universitätsklinikum Ulm steht mit seinen Mitarbeitenden für eine moderne Patientenversorgung mit hoher Qualität, Spitzenforschung und eine auf die Zukunft ausgerichtete medizinische Lehre sowie Ausbildung in attraktiven Berufsfeldern. Voraussetzungen dafür sind qualifizierte und engagierte Mitarbeitende.

Wir suchen zum nächstmöglichen Zeitpunkt

wissenschaftliches Personal (w/m/d)

zur Mitarbeit in unserem Schwerpunkt Analyse und Sequenzierung von angeborenen Varianten des Immunsystems und des Hämatopoesesystems am Institut für Transfusionsmedizin.

Analyse von Exom- und Genomdatensätzen mit Schwerpunkt Immundefekte, Hämatopoesedefekte, Blutgruppen und mikrobielle Pathogene
Mitarbeit in der Betreuung des Geräteparks (z. B. Sangersequenzierung, Next-Generation-Sequencing (NGS), Third-Generation-Sequencing (TGS))
Einführung und Validierung neuer Analysesoftwarelösungen im Bereich NGS und TGS
Mitarbeit in Forschungsprojekten, beispielsweise der Entwicklung und Einführung neuer molekulargenetischer Methoden und bei der Betreuung von Auszubildenden und Studierenden
Mithilfe bei der Einführung von Deep Learning Tools
Mitarbeit an der Datenauswertung, Datenanalyse sowie der Ergebnispräsentation auf entsprechenden Kongressen und in Zeitschriften

Erfolgreich abgeschlossener Masterstudiengang mit Promotion im Bereich Mathematik, Biometrie, (Bio-)Informatik oder verwandte Studiengänge, Biologie, Molekulare Medizin, Pharmazeutische Biotechnologie, Bioinformatik, Medizin oder verwandte Studiengänge
Eigenhändige Erfahrung in der Sequenzierung eukaryotischer Gene, von der DNA-Isolation über die Sequenzierung bis hin zur Bewertung von Varianten (z. B. nach ACMG-Klassifikation)
Vorerfahrungen in der Auswertung genetischer Sequenzierdaten, idealerweise darunter auch exom- bzw. genomweite Analysen
Deutsch- und Englischkenntnisse, mindestens C1
Neugier, insbesondere, neue Technologien zu evaluieren und anzuwenden
Flexibilität sowie Teamfähigkeit
Freude an verantwortungsbewusstem und selbstständigem Arbeiten

Eine interessante, sinnstiftende Tätigkeit verbunden mit der Möglichkeit, Grundlagen- und Anwendungsforschung zu kombinieren
Mitarbeit in einem breit aufgestellten, gemischten Team aus Ärzten (m/w/d), Wissenschaftlern (m/w/d), Technischen Assistenten (m/w/d) und Studierenden
Räumlich und technisch hochwertig ausgestattete Labore mit breitem Methodenspektrum (u. A. Third-Generation Sequencing, FACS, CRISPR/Cas9, IPSC-Modelle, Live-cell imaging, WB, ELISA, PCR/qPCR, etc.)
Hochmoderner Gerätepark, inklusive Third-Generation-Sequencing
Einen Arbeitsplatz in einem krisensicheren Unternehmen der Gesundheits- und Sozialwirtschaft
Abwechslungsreiche, eigenverantwortliche Arbeit in einem fachlich kompetenten und engagierten Team
Bezahlung nach TV-L sowie betriebliche Altersvorsorge
Unterstützung bei der Vereinbarkeit von Beruf und Familie
Vielfältige Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten sowie betriebliche Gesundheitsförderung
Personalwohnheim
Jobticket und rabattiertes Deutschlandticket

Die Stelle ist zunächst auf vier Jahre befristet mit der Option auf Verlängerung. Eine daran anschließende Beschäftigung wird angestrebt. Das Forschungsprojekt ist angesiedelt am Institut für Transfusionsmedizin des Universitätsklinikums Ulm (Direktor: Prof. Dr. H. Schrezenmeier) in Zusammenarbeit mit dem Institut für Klinische Transfusionsmedizin und Immungenetik Ulm gemeinnützige GmbH (Gemeinschaftsunternehmen des DRK-Blutspendedienstes Baden-Württemberg | Hessen gemeinnützige GmbH und des Universitätsklinikums Ulm AöR).
Der Einsatz erfolgt in der Abteilung Molekulare Diagnostik, Molekulare Therapie und Experimentelle Transplantation (Leiter: PD Dr. D. Messerer).

Universitätsklinikum Ulm

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2024-05-05