Bioinformatiker:in in Pflanzengenomik (m/w/d) (Bioinformatiker/in)

With cutting-edge research in the fields of ENERGY, HEALTH and MATTER, around 1,500 employees from more than 70 nations at Helmholtz-Zentrum Dresden-Rossendorf (HZDR) are committed towards mastering the great challenges of the society today.

The Department of Information Services and Computing is the service, consultation and coordination centre for the Information Infrastructure of the HZDR.

The Group High Performance Computing is looking for a DevOps Engineer (f/m/d) - Cloud Infrastructure and Data Services.

Your tasks

- Analyze, optimize and adapt HZDR infrastructure and data services
- Operate scientific cloud infrastructure on top of like Kubernetes, OpenStack and Proxmox
- Support research groups in using infrastructure and data services

Your profile

- Completed university studies (Bachelor/Master/Diploma) in the field of Computer Science, Mathematics, Natural Sciences or a related
- Advanced training for a DevOps professional (f/m/d) is an advantage
- Knowledge of - Common programming languages and container orchestration tools (e.g. Docker, Podman, Apptainer, Kubernetes)
- OpenStack cloud platform and its components
- Proxmox virtualization platform and its components
- Basic knowledge in - Complex and distributed networks (Desgin, protocols, etc.)
- Complex and distributed services and systems (Databases, storage, authentication, etc.)
- Experience - In software development and programming (GitLab, CI/CD)
- With configuration management tools (e.g. Ansible)
- Willingness to cooperate intensively with developers and users from science and industry
- Knowledge of the Linux operating system and Bash scripting

Our offer

- A vibrant research community in an open, diverse and international work environment
- Scientific excellence and extensive professional networking opportunities
- Salary and social benefits in accordance with the collective agreement for the public sector (TVöD-Bund) including 30 days of paid holiday leave, company pension scheme (VBL)
- We support a good work-life balance with the possibility of part-time employment, mobile working and flexible working hours
- Numerous company health management offerings
- Employee discounts with well-known providers via the platform Corporate Benefits
- An employer subsidy for the "Deutschland-Ticket Jobticket"

We look forward to receiving your application documents (including cover letter, CV, diplomas/transcripts, etc.), which you can submit via our online-application-system.

Du teilst unsere Leidenschaft für Innovationen und Technologien und willst dich den Herausforderungen der Zukunft stellen? Dann komm zu FERCHAU: als Software Engineer (m/w/d) Data Science Medizintechnik. Wir realisieren spannende Projekte für namhafte Kunden in den Bereichen Pharma und Medizintechnik und sorgen für sichere und nachhaltige Technologielösungen.

Software Engineer (m/w/d) Data Science Medizintechnik

Ihre Aufgaben:

Dein Aufgabengebiet

- Softwareentwicklung für Medizinprodukte und Prüfaufbauten entsprechend der geltenden Normen
- Anforderungsanalyse und Risikomanagement
- Entwicklung und Implementierung von Algorithmen zur Messdatenanalyse und zur Bildverarbeitung
- Versuchsplanung und Auswertung von Testserien mit statistischen und Data Mining-Methoden
- Implementierung, Dokumentation und Überwachung von Softwareentwicklungsprozessen und Softwareentwicklungsumgebungen

Deine Benefits bei uns

- Unbefristeter Arbeitsvertrag
- Betriebliche Altersvorsorge
- Mehr als der BAP: Wir bieten Sonderurlaub, Kindergartenzuschuss, Jubiläumszuwendungen u. v. m.
- Flexible Arbeitszeitgestaltung durch Gleitzeitregelungen
- Weiterbildungsangebote unseres Inhouse-Instituts, der ABLEacademy (E-learnings, Trainings und Seminare)

Ihre Qualifikationen:

Dein Profil

- Abgeschlossenes Studium in Bioinformatik, Informatik, Medizintechnik oder vergleichbaren Schwerpunkt
- Kenntnisse im Umgang mit relevanten Normen und Standards für Medizinprodukte
- Praktische Erfahrung mit Datenanalysemethoden bzw. Algorithmen zur Bildverarbeitung und -analyse
- Kenntnisse zur Programmierung in C/C++, Python und R
- Gute Deutsch- und Englischkenntnisse in Wort und Schrift

Lust auf die nächste Herausforderung? Dann sollten wir uns unbedingt kennenlernen! Am schnellsten geht es, wenn du dich direkt bewirbst - gern online oder per E-Mail unter der Kennziffer VA41-36363-JEN bei Frau Michelle Audehm. Lass uns gemeinsam das nächste Level nehmen und Technologie nach vorn bringen!

Gemeinsam besser. Fürs Leben.

Wir sind das Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf (UKE) – und stehen für exzellente Kompetenz in Forschung, Lehre und der vollumfänglichen Gesundheitsversorgung in unseren Kliniken. Unsere rund 15.300 Mitarbeiter:innen streben jeden Tag aufs Neue danach, mit ihrem Beitrag die Welt ein bisschen gesünder zu machen.

Es ist unser Anspruch, eine der führenden Universitätskliniken zu sein – und gleichzeitig der beste Arbeitgeber unserer Branche. So glauben wir im UKE fest daran, dass erfolgreiches und erfüllendes Arbeiten im Einklang mit den persönlichen Bedürfnissen und individuellen Lebensentwürfen der Mitarbeitenden stehen sollte. Und so unterschiedlich diese sind, so vielfältig ist unser Angebot an individuellen Lösungen.
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Willkommen im UKE.

Job-ID:  J000004587
Art der Anstellung:  Befristet
Arbeitszeit:  Vollzeit/Teilzeit
Bewerben bis:  02.06.2025
Unternehmensteil:  UKE_Zentrum für Diagnostik
Tätigkeitsbereich:  Forschung & Wissenschaft
Bereich:  Institut für Immunologie

Das macht die Position aus

Das Institut für Immunologie im UKE ist Teil des Zentrums für Diagnostik. Seine Aufgaben sind die Labordiagnostik von immunvermittelten Erkrankungen, die Forschung und die akademische Lehre für Studierende auf dem Gebiet der Immunologie. Es führt zudem wissenschaftliche Untersuchungen als Dienstleistung durch. Im DIN EN ISO 15189:2023 akkreditierten medizinischen Laboratorium wird in der Krankenversorgung routinemäßig vorwiegend folgende Analytik durchgeführt:

- Immunphänotypisierung mittels Durchflusszytometrie
- Bestimmung von Autoantikörpern mittels Immunfluoreszenz und Festphasen-Assays
- Diagnostik von monoklonalen Gammopathien mittels Immunfixations-Elektrophorese
- Allergiediagnostik
- Proteindiagnostik (z. B. ELISA)

Die Immunologie ist ein zentrales Fach für fast alle Bereiche der Medizin, da das Immunsystem an den meisten Erkrankungen beteiligt ist und immer mehr Behandlungsmethoden zur Verfügung stehen, die auf neuen Erkenntnissen über das Immunsystem beruhen. Das Diagnostiklabor folgt durch den stetigen Einsatz neuer Technologien und Untersuchungsverfahren den Bedarfen für die Krankenversorgung.

Das Projekt umfasst die Implementierung neuer Technologien im Bereich der Immunphänotypisierung sowie Multiplex-Analytik und deren Datenintegration mit Hilfe eines Laborinformationssystem zur Weiterentwicklung der Diagnostik von immun-vermittelten Erkrankungen. Das Institut für Immunologie besitzt die Berechtigung zur Weiterbildung zum:r Fachimmunolog:in der Deutschen Gesellschaft für Immunologie (DGfI). Sie erhalten die Möglichkeit, in einem engagierten Team neue Untersuchungsverfahren für die Diagnostik einzuführen und dabei aktuelle wissenschaftliche Fragestellungen im Bereich der immun-vermittelten Erkrankungen zu adressieren. Die Möglichkeit zur Weiterbildung zum:r Fachimmunolog:in sowie Durchführung von Lehrveranstaltungen des Institutes für Immunologie sind gegeben.

Ihre Aufgaben:

- Unterstützung bei der Einführung neuer Plattformen für die Bereiche Immunphänotypisierung und Multiplex Analytik im Diagnostiklabor
- Implementierung und Validierung von Datenintegrationsprozessen zur Visualisierung komplexer Daten
- Bearbeitung wissenschaftlicher Fragestellungen im Bereich der Diagnostik immun-vermittelter Erkrankungen
- Implementierung neuer Untersuchungsverfahren entsprechend der IVDR
- Automatisierung von Workflows und Datenverarbeitungsprozessen zur Steigerung der Effizienz

Diese Position ist projektbedingt vorerst auf 3 Jahre befristet. Eine Verlängerung ist avisiert.

Darauf freuen wir uns

- Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium inklusive Promotion im Bereich Lebenswissenschaften, Bioinformatik oder eines verwandten Studienfaches
- Fundierte Kenntnisse in der Erhebung und Analyse von FACS-Durchflusszytometrie Daten
- Kenntnisse in der Anwendung von Bioinformatik-Software und Programmiersprachen zur Darstellung komplexer Datensätze (z. B. „R“)
- Interesse an immunologischer Diagnostik
- Engagement, Koordinations- und Organisationsgeschick, schnelle Auffassungsgabe, Selbständigkeit, Teamfähigkeit und sehr gute Kommunikationsfähigkeit

Immunitätsstatus

Eine Einstellung ist nur möglich, wenn nach den jeweils geltenden (gesetzlichen und medizinischen) Vorgaben gegen das Masernvirus ein vollständiger Immunisierungs- bzw. Immunitätsnachweis vorliegt. Dies ist vor Beschäftigungsbeginn durch entsprechende Unterlagen (z.B. Impfausweis) nachzuweisen.

Das bieten wir

- Attraktive Bezahlung nach TVöD/VKA (https://www.uke.de/karriere/das-uke-als-arbeitgeber/verguetung-tarifvertraege/index.html)
- Krisensicherer Arbeitsplatz, sinnstiftende Tätigkeit, wertschätzendes Miteinander
- Strukturierte Einarbeitung und offener Wissensaustausch im Team
- Umfangreiche Fort- und Weiterbildungsprogramme an unserer UKE-Akademie für Bildung und Karriere (https://www.uke.de/organisationsstruktur/zentrale-bereiche/uke-akademie-fuer-bildung-karriere/fort-weiterbildung/index.html)
- Möglichkeiten zur Mitgestaltung unserer Personalpolitik „UKE INside“ in berufsgruppen- und hierarchieübergreifenden Projekten
- Nachhaltig unterwegs: Zuschüsse zum Deutschlandticket als Jobticket und Dr. Bike Fahrradservice
- Familienfreundliches Arbeitsumfeld: Kooperation zur Kinderbetreuung, kostenlose Ferienbetreuung, Beratung für Beschäftigte mit pflegebedürftigen Angehörigen
- Ausgezeichnete Gesundheits-, Präventions- und Sportangebote
- Unser Mitarbeitendenrestaurant bietet eine reiche Auswahl an kulinarischen Angeboten; weitere Angebote gibt es in den „Health Kitchen“ Cafés und Bistros und in einem Supermarkt direkt auf dem Gelände

Kontakt ins UKE

Kontakt zum Fachbereich
Herr Prof Dr. med. Felix Stahl, PhD
+49 (0) 40 7410-54697
[email protected]

Kontakt zum Recruiting
Recruiting Team
+49 (0) 40 7410-52599

Über uns

Wir leben Diversität und schätzen Vielfalt

Wir bieten ein Arbeitsumfeld, das unabhängig von Alter, Geschlecht, sexueller Identität, Behinderung, ethnischer und sozialer Herkunft oder Religion gleiche Chancen ermöglicht. Dieses bestätigen wir mit dem Beitritt zur Charta der Vielfalt. Wir streben ausdrücklich eine Erhöhung des Anteils von Frauen in Führungspositionen an, insbesondere beim wissenschaftlichen Personal in Forschung und Lehre. Gleiches gilt im Falle einer Unterrepräsentation eines Geschlechts im ausschreibenden Bereich. Personen mit Schwerbehinderung werden bei gleicher Eignung, Befähigung und fachlicher Leistung vorrangig berücksichtigt.

> Hier mehr zum Thema „Diversity im UKE“ erfahren. (https://www.uke.de/allgemein/karriere/das-uke-als-arbeitgeber/diversity-im-uke/index.html)

State-of-the-art medicine and nursing care you can rely on! - Since being founded in 1815, Universitätsklinikum Erlangen has offered medicine of the highest standard and incorporated the latest insights from medical research and state-of-the-art equipment into diagnosis and therapy. More than 9.800 employees from approximately 50 different occupations are needed to provide the wide range of services offered by Universitätsklinikum Erlangen, ensuring our patients receive the very best care around the clock.
The Department of Orthodontics and Orofacial Orthopedics at FAU is currently looking for a highly motivated doctoral researcher (full-time, 100%) in the field of artificial intelligence for dental image analysis.
As a doctoral candidate, you will join a multidisciplinary research team working at the intersection of Artificial Intelligence, Medical Image Analysis, and Orthodontics. Your research will focus on developing advanced deep learning and machine learning models for the automated analysis of dental and orofacial images/data including MRIs, radiographs, photographs, etc., enabling improved diagnosis and treatment planning in orthodontics and dentistry.

Tasks:

- Conducting cutting-edge research in AI-driven dental image analysis, particularly in segmentation, landmark detection, reconstruction, and predictive modeling, etc.
- Developing and optimizing deep learning and computer vision algorithms for automated assessment of dental and orofacial structures.
- Collaborating with experts in orthodontics, radiology, and AI to translate research findings into clinically useful applications.
- Publishing peer-reviewed papers in high-impact journals and presenting findings at international conferences.
- Assisting in teaching activities and mentoring Bachelor’s/Master’s students in related research areas.

Know-How:

- A Master’s degree (or expected completion soon) in Computer Science, Artificial Intelligence, Biomedical Engineering, Computational Engineering, Biomedical Sciences, or a related field.
- Strong programming skills, particularly in Python (experience with frameworks such as PyTorch is a plus).
- A background in machine learning, deep learning and medical image analysis is highly preferred.
- A research-oriented attitude with good analytical and problem-solving skills.
- Demonstrated experience through publications is considered an advantage.
- Strong English communication skills, both written and spoken.
- Highly motivated, creative, and able to work both independently and as part of a team.

Comments:

- Motivation letter outlining your research interests and why you are suited for this position.
- Detailed CV, including your academic background, research experience, and relevant publications.
- Transcripts of records for your Master’s degree.
- Two recommendation letters from academic references.

We Offer:

- The position is funded for three years. A six-month probationary period applies.
- The opportunity to work in a highly interdisciplinary environment, collaborating with leading experts in AI, medical imaging, and orthodontics.
- Access to state-of-the-art computing facilities and medical imaging datasets.
- Close collaboration between the Faculty of Medicine and the Faculty of Engineering at FAU.
- A stimulating and international research atmosphere at FAU.
- Salary and benefits according to the German public sector pay scale (TV-L E13, 100%).

Contact Person:

Prof. Dr.-Ing. Y. Xia / W2-Professor / 09131 85 45675

Applications:

Uniklinikum Erlangen
Zahnklinik 3 - Kieferorthopädie
Direktionssekretariat
Corina Goldschmidt
Glückstr. 11
91054 Erlangen

Work Your Magic with us!

Ready to explore, break barriers, and discover more? We know you’ve got big plans – so do we! Our colleagues across the globe love innovating with science and technology to enrich people’s lives with our solutions in Healthcare, Life Science, and Electronics. Together, we dream big and are passionate about caring for our rich mix of people, customers, patients, and planet. That's why we are always looking for curious minds that see themselves imagining the unimaginable with us.

United As One for Patients, our purpose in Healthcare is to help create, improve and prolong lives. We develop medicines, intelligent devices and innovative technologies in therapeutic areas such as Oncology, Neurology and Fertility. Our teams work together across 6 continents with passion and relentless curiosity in order to help patients at every stage of life. Joining our Healthcare team is becoming part of a diverse, inclusive and flexible working culture, presenting great opportunities for personal development and career advancement across the globe.

Your Role

AsPostdocComputational Oncologyin the Research Unit Oncology, you will join a team of highly motivated scientists dedicated to discovering the cancer drugs of tomorrow. You will analyze functional genomics screens combined with multi-modal patient-derived data to generate novel drug target hypotheses. You will draw from your deep understanding of the underlying biology (tumor biology and/or tumor immunology), expertise in data analysis methods and robust coding skills. Operating at the intersection of biology and data science, you will generate insights from complex datasets for scientists without coding skills and contribute to the digital literacy within your department. You will interact closely with the R&D bioinformaticians and work in cross-functional drug discovery teams as well as external collaborations.

The position is limited to 2 years.

Who you are

- PhD in Biology, Biotechnology, Molecular Medicine, Bioinformatics or related discipline
- Thorough understanding of oncology in at least one of the following areas: cancer cell signaling, antibody drug conjugates and/or tumor immunology
- Extensive hands-on programming experience for biological data analysis (R or Python) including maintenance of code quality and documentation (e.g. Git)
- Hands-on experience analyzing and interpreting data from CRISPR screens and ideally DNA-seq data
- Expertise in NGS data processing is a plus
- Excellent written and spoken English skills
- Excellent team player, eager to work in multidisciplinary teams

What we offer:We are curious minds that come from a broad range of backgrounds, perspectives, and life experiences. We celebrate all dimensions of diversity and believe that it drives excellence and innovation, strengthening our ability to lead in science and technology. We are committed to creating access and opportunities for all to develop and grow at your own pace. Join us in building a culture of inclusion and belonging that impacts millions and empowers everyone to work their magic and champion human progress!

Apply now and become a part of our diverse team!

“Research for a life without cancer" is our mission at the German Cancer Research Center. We investigate how cancer develops, identify cancer risk factors and look for new cancer prevention strategies. We develop new methods with which tumors can be diagnosed more precisely and cancer patients can be treated more successfully. Every contribution counts – whether in research, administration or infrastructure. This is what makes our daily work so meaningful and exciting.

Together with university partners at seven renowned partner sites, we have established the German Cancer Consortium (DKTK).

The Department of Translational Cancer Research and the Institute of Experimental Cancer Therapy at the DKTK partner site Munich is offering for as soon as possible 2 PhD Student Positions in Pancreatic Cancer Immunology and Computational Biology.

We are deploying advanced in vitro and in vivo model systems, genetic perturbations and single cell technologies with spatial readouts to study the distinct routes of tumor evolution and modes of immunosuppression we identified in our previous work in subtypes of pancreatic cancer (e.g., Nat Commun. 2023 14:2642 and 14:1201; Nature Cancer 2022 3:318-336, Cancer Discovery 2021 11:3158-3177, Nature 2018 554:62-68; Nat. Rev. Cancer 2017 17:239-253; Nat. Commun. 2016, 7:10770; Nat Med. 2014, 20:1340-7). During the past decade, our lab has generated a comprehensive resource of pancreatic primary tumors and primary cell cultures. Multiple NGS methods and biological readouts have been conducted to decipher the molecular makeup and phenotypes of these tumors. The advertised projects focus on (1) unraveling targetable nodes of the cancer-immune niche and its impact on treatment response and resistance, (2) understanding the contribution of cancer associated fibroblasts towards immunosuppression, and (3) developing computational single cell and spatial transcriptomics pipelines to investigate tumor subtype specific genetic interactions in close collaboration with the Theis lab at Helmholtz Center Munich.

We are an enthusiastic and international team and offer intensive training and mentoring.

Your Tasks

The successful candidates will have the opportunity to:

- Gain important insights into clinically relevant aspects of cancer development and therapy
- Perform state-of-the-art in vivo experiments and large-scale drug and genetic screens
- Learn and apply a wide spectrum of genetic, molecular and cell biology, biochemical as well as immunological and bioinformatics techniques to study translational aspects of cancer (e.g. Cre/loxP and Flp/FRT based dual- and triple recombinase systems, organoid culture, orthotopic transplantations of cells/organoids, CRISPR/Cas9, molecular in vivo imaging, quantitative proteomics/phosphoproteomics, multiple transcriptomics and genomics approaches, single cell sequencing, histocytometry)
- Set up bioinformatics platforms and develop computational pipelines for the analysis of bulk and single cell RNA-sequencing, DNA-sequencing datasets and proteomics
- Integrate these datasets with molecular (WES, WGBS, lcWGS, ChIPseq, ATACseq), phenotypic (e.g. histology), drug screening and clinical information
- Interact within a diverse and multidisciplinary environment of biologists, clinicians, computational scientists and mathematicians within the TranslaTUM.

Your Profile

We are looking for exceptional self-motivated bright individuals with a Diploma or Master’s degree in bioinformatics, biochemistry, biology, molecular/translational medicine or related subjects. Previous exposure to and experience with basic biochemical and molecular biology techniques, proteomics or bioinformatics as well as interests in molecular aspects of cancer research are essential. Due to the interdisciplinary framework and close collaboration between wet-lab and computational scientists, good communicative skills in English are essential. German language skills are not required.

We Offer

- Excellent framework conditions: state-of-the-art equipment and opportunities for international networking at the highest level
- Access to international research networks
- Doctoral salary with the usual social benefits
- 30 days of vacation per year
- Flexible working hours
- Possibility of part-time work
- Family-friendly working environment
- Sustainable travel to work: subsidized Germany job ticket
- Unleash your full potential: targeted training and mentoring through the DKFZ International PhD Program and DKFZ Career Service
- Our Corporate Health Management Program offers a holistic approach to your well-being

Are you interested?

Then become part of the DKFZ and join us in contributing to a life without cancer!

Contact:

Prof. Dr. Dieter Saur
Phone: +49 89 4140 9130

​Duration: The positions are limited to 3 years. An extension is possible.

Application Deadline: 03.05.2025

Applications by e-mail cannot be accepted.

Please also note that we cannot return applications submitted by post.

We are convinced that an innovative research and working environment thrives on the diversity of its employees. Therefore, we welcome applications from talented people, regardless of gender, cultural background, nationality, ethnicity, sexual identity, physical ability, religion and age. People with severe disabilities are given preference if they have the same aptitude.

Notice: We are subject to the regulations of the Infection Protection Act (IfSG). Therefore, all our employees must provide proof of immunity against measles.

“Research for a life without cancer" is our mission at the German Cancer Research Center. We investigate how cancer develops, identify cancer risk factors and look for new cancer prevention strategies. We develop new methods with which tumors can be diagnosed more precisely and cancer patients can be treated more successfully. Every contribution counts – whether in research, administration or infrastructure. This is what makes our daily work so meaningful and exciting.

Together with university partners at seven renowned partner sites, we have established the German Cancer Consortium (DKTK).

The Department of Translational Cancer Research and the Institute of Experimental Cancer Therapy at the DKTK partner site Munich is offering for as soon as possible 2 Postdoc Positions in Pancreatic Cancer Immunology and Computational Biology.

We are deploying advanced in vitro and in vivo model systems, genetic perturbations and single cell technologies with spatial readouts to study the distinct routes of tumor evolution and modes of immunosuppression we identified in our previous work in subtypes of pancreatic cancer (e.g., Nat Commun. 2023 14:2642 and 14:1201; Nature Cancer 2022 3:318-336, Cancer Discovery 2021 11:3158-3177, Nature 2018 554:62-68; Nat. Rev. Cancer 2017 17:239-253; Nat. Commun. 2016, 7:10770; Nat Med. 2014, 20:1340-7). During the past decade, our lab has generated a comprehensive resource of pancreatic primary tumors and primary cell cultures. Multiple NGS methods and biological readouts have been conducted to decipher the molecular makeup and phenotypes of these tumors. The advertised projects focus on (1) unraveling targetable nodes of the cancer-immune niche and its impact on treatment response and resistance, (2) understanding the contribution of cancer associated fibroblasts towards immunosuppression, and (3) developing computational single cell and spatial transcriptomics pipelines to investigate tumor subtype specific genetic interactions in close collaboration with the Theis lab at Helmholtz Center Munich.

We are an enthusiastic and international team and offer intensive training and mentoring.

The Department of Translational Cancer Research and the Institute of Experimental Cancer Therapy at the DKTK partner site Munich is seeking two postdocs to join the group as soon as possible.

Your Tasks

The successful candidates will have the opportunity to:

- Gain important insights into clinically relevant aspects of cancer development and therapy
- Perform state-of-the-art in vivo experiments and large-scale drug and genetic screens
- Learn and apply a wide spectrum of genetic, molecular and cell biology, biochemical as well as immunological and bioinformatics techniques to study translational aspects of cancer (e.g. Cre/loxP and Flp/FRT based dual- and triple recombinase systems, organoid culture, orthotopic transplantations of cells/organoids, CRISPR/Cas9, molecular in vivo imaging, quantitative proteomics/phosphoproteomics, multiple transcriptomics and genomics approaches, single cell sequencing, histocytometry)
- Set up bioinformatics platforms and develop computational pipelines for the analysis of bulk and single cell RNA-sequencing, DNA-sequencing datasets and proteomics
- Integrate these datasets with molecular (WES, WGBS, lcWGS, ChIPseq, ATACseq), phenotypic (e.g. histology), drug screening and clinical information
- Interact within a diverse and multidisciplinary environment of biologists, clinicians, computational scientists and mathematicians within the TranslaTUM.

Your Profile

We are looking for exceptional self-motivated bright individuals with a Diploma or Master’s degree in bioinformatics, biochemistry, biology, molecular/translational medicine or related subjects. Previous exposure to and experience with basic biochemical and molecular biology techniques, proteomics or bioinformatics as well as interests in molecular aspects of cancer research are essential. Due to the interdisciplinary framework and close collaboration between wet-lab and computational scientists, good communicative skills in English are essential. German language skills are not required.

Interested candidates should send one pdf file with a CV, cover letter, certificates, and letters of recommendation.

We Offer

- Excellent framework conditions: state-of-the-art equipment and opportunities for international networking at the highest level
- Remuneration according to TV-L incl. occupational pension plan and capital-forming payments
- 30 days of vacation per year
- Flexible working hours
- Possibility of part-time work
- Family-friendly working environment
- Sustainable travel to work: subsidized Germany job ticket
- Our Corporate Health Management Program offers a holistic approach to your well-being
- Develop your full potential: access to the DKFZ International Postdoc Program and DKFZ Career Service with targeted offers for your personal development to further develop your talents

Are you interested?

Then become part of the DKFZ and join us in contributing to a life without cancer!

Contact:

Prof. Dr. Dieter Saur
Phone: +49 89 4140 9130

​Duration: The positions are initially limited to 2 years with the possibility of prolongation.

Application Deadline: 03.05.2025

Applications by e-mail cannot be accepted.

Please also note that we cannot return applications submitted by post.

We are convinced that an innovative research and working environment thrives on the diversity of its employees. Therefore, we welcome applications from talented people, regardless of gender, cultural background, nationality, ethnicity, sexual identity, physical ability, religion and age. People with severe disabilities are given preference if they have the same aptitude.

Notice: We are subject to the regulations of the Infection Protection Act (IfSG). Therefore, all our employees must provide proof of immunity against measles.

Bioinformatiker:in in Pflanzengenomik (m/w/d)

102731

Vollzeit
39 Std./Woche

Neuherberg bei München

Anteilig Home Office möglich

Bei Helmholtz Munich entwickeln wir bahnbrechende Lösungen für eine gesündere
Gesellschaft in einer sich schnell verändernden Welt. Wir glauben, dass
vielfältige Perspektiven Innovationen vorantreiben. Durch starke Netzwerke
beschleunigen wir den Transfer neuer Ideen aus dem Labor in die Praxis, um
Leben zu verbessern.

Die Forschungseinheit Genomik und Systembiologie pflanzlicher Genome (PGSB)
konzentriert sich auf die Analyse von pflanzengenomischen Daten mithilfe
bioinformatischer Methoden. Unsere Mission besteht darin, Möglichkeiten für
eine nachhaltige Nutzung von Pflanzen zu entwickeln und zu verstehen, wie sich
der Klimawandel auf Nutzpflanzen, die Lebensmittelsicherheit und die
menschliche Gesundheit auswirkt.

Deine Aufgaben

- Selbstständige Planung und Durchführung wissenschaftlicher Projekte im
Bereich der Pflanzengenomik
- Organisation, Durchführung und Auswertung von bioinformatischen Daten
- Anleitung von Doktorand:innen, Bachelor-/Masterstudent:innen und
technischen Hilfskräften bei der Durchführung von Experimenten sowie der
Erstellung von Arbeitsberichten, Doktorarbeiten, Seminarvorträgen und
Posterpräsentationen
- Verfassen von Manuskripten und Anträgen auf Forschungsförderung
- Statistische Analyse der komplexen pflanzengenomischen Daten
- Präsentation von Projektergebnissen und Erstellung von Veröffentlichungen

Dein Profil

- Abgeschlossenes Universitätsstudium im Bereich Bioinformatik, Biologie oder
verwandter Disziplinen mit Promotion
- Tiefgehende Kenntnisse in der Planung und Durchführung von Feld- und
Gewächshaus-Experimenten zur Erfassung agronomischer und pflanzenbiologischer
Merkmale
- Gute Kenntnisse im Bereich der Genomik, Genetik und Proteomik, sowie in
statistischer und bioinformatischer Auswertung von experimentellen
Proteomikdaten
- Umfangreiche Erfahrung in der genomischen Analyse von komplexen Daten aus
den Modellorganismen Mais und/oder Gerste sowie in der Analyse pflanzlicher
Pan-Genome
- Programmierkenntnisse in mindestens einer Sprache (Phyton, R, Perl)

Bei Vorliegen der Voraussetzungen ist eine Eingruppierung bis E 13 möglich.
Sozialleistungen richten sich nach dem Tarifvertrag für den öffentlichen Dienst
(Bund). Die Stelle ist (zunächst) auf 1 Jahr befristet, die Möglichkeit einer
längerfristigen Perspektive besteht.

Geschäftsführer Matthias Tschöp und Mike Frieser:

„Wir glauben, dass Vielfalt der Schlüssel zu bahnbrechender Forschung und
innovativen Lösungen ist. Unsere flexiblen Arbeitszeitmodelle und die
Möglichkeit zum mobilen Arbeiten schaffen ein geeignetes Umfeld für die
Vereinbarkeit von Beruf und Privatleben. Für uns ist der Beitrag zu einer
gesünderen Gesellschaft an einem so inspirierenden Arbeitsplatz wirklich
wertvoll.“

Lerne uns kennen

Benefits

- Wissenschaftliche Ressourcen Hochmoderne Infrastruktur und Core Facilities
- Potenzial fördern vielfältiges Inhouse-Angebot für zielgerichtete
Weiterbildungsmöglichkeiten
- Gesundheitsangebot Sport, Betriebsarzt, mentale Gesundheit
- Familienfreundlich KITA, Ferienbetreuung, Elder Care
- Karriere beschleunigen Postdoc-Programm, wissenschaftliche Trainings und
Career Center mit maßgeschneiderten Angeboten
- Leadership stärken vielfältige, maßgeschneiderte Entwicklungsprogramme für
Führungskräfte

Interesse geweckt?

Falls noch Fragen offen sind, hilft gerne Hr. Dr. Manuel Spannagl,
+498931873948, weiter.

Unser Recruiting erfolgt dezentral - deine Bewerbung wird direkt von der
Fachabteilung gesichtet, in der du möglicherweise künftig arbeiten wirst.