PhD in Artificial Intelligence for Dental Image Analysis (m/f/d) (Bioinformatiker/in)

State-of-the-art medicine and nursing care you can rely on! - Since being founded in 1815, Universitätsklinikum Erlangen has offered medicine of the highest standard and incorporated the latest insights from medical research and state-of-the-art equipment into diagnosis and therapy. More than 9.800 employees from approximately 50 different occupations are needed to provide the wide range of services offered by Universitätsklinikum Erlangen, ensuring our patients receive the very best care around the clock.
The Department of Orthodontics and Orofacial Orthopedics at FAU is currently looking for a highly motivated doctoral researcher (full-time, 100%) in the field of artificial intelligence for dental image analysis.
As a doctoral candidate, you will join a multidisciplinary research team working at the intersection of Artificial Intelligence, Medical Image Analysis, and Orthodontics. Your research will focus on developing advanced deep learning and machine learning models for the automated analysis of dental and orofacial images/data including MRIs, radiographs, photographs, etc., enabling improved diagnosis and treatment planning in orthodontics and dentistry.

Tasks:

- Conducting cutting-edge research in AI-driven dental image analysis, particularly in segmentation, landmark detection, reconstruction, and predictive modeling, etc.
- Developing and optimizing deep learning and computer vision algorithms for automated assessment of dental and orofacial structures.
- Collaborating with experts in orthodontics, radiology, and AI to translate research findings into clinically useful applications.
- Publishing peer-reviewed papers in high-impact journals and presenting findings at international conferences.
- Assisting in teaching activities and mentoring Bachelor’s/Master’s students in related research areas.

Know-How:

- A Master’s degree (or expected completion soon) in Computer Science, Artificial Intelligence, Biomedical Engineering, Computational Engineering, Biomedical Sciences, or a related field.
- Strong programming skills, particularly in Python (experience with frameworks such as PyTorch is a plus).
- A background in machine learning, deep learning and medical image analysis is highly preferred.
- A research-oriented attitude with good analytical and problem-solving skills.
- Demonstrated experience through publications is considered an advantage.
- Strong English communication skills, both written and spoken.
- Highly motivated, creative, and able to work both independently and as part of a team.

Comments:

- Motivation letter outlining your research interests and why you are suited for this position.
- Detailed CV, including your academic background, research experience, and relevant publications.
- Transcripts of records for your Master’s degree.
- Two recommendation letters from academic references.

We Offer:

- The position is funded for three years. A six-month probationary period applies.
- The opportunity to work in a highly interdisciplinary environment, collaborating with leading experts in AI, medical imaging, and orthodontics.
- Access to state-of-the-art computing facilities and medical imaging datasets.
- Close collaboration between the Faculty of Medicine and the Faculty of Engineering at FAU.
- A stimulating and international research atmosphere at FAU.
- Salary and benefits according to the German public sector pay scale (TV-L E13, 100%).

Contact Person:

Prof. Dr.-Ing. Y. Xia / W2-Professor / 09131 85 45675

Applications:

Uniklinikum Erlangen
Zahnklinik 3 - Kieferorthopädie
Direktionssekretariat
Corina Goldschmidt
Glückstr. 11
91054 Erlangen

Das Medizinische Zentrum für Informations- und Kommunikationstechnik (MIK), die zentrale IT-Serviceeinrichtung mit ca. 200 Mitarbeitenden, eine der zentralen Einrichtungen im Universitätsklinikum Erlangen, erbringt umfassende Dienstleistungen für die 25 Kliniken, 18 Abteilungen und acht Institute sowie deren verbundene Einrichtungen, die kaufmännische Verwaltung und die übrigen zentralen Einrichtungen. Das MIK ist unter anderem für die Konzeption und Umsetzung von IT-Anforderungen, die Bereitstellung einer an den Geschäftsprozessen des Klinikums orientierten IT-Infrastruktur und die Gewährleistung des umfassenden Informationsaustausches zwischen allen beteiligten Bereichen des Universitätsklinikums und der medizinischen Fakultät zuständig.

Der Lehrstuhl für Medizinische Informatik arbeitet an verschiedenen Projekten der angewandten Informationsverarbeitung – sowohl im Krankenhaus als auch institutionsübergreifend. Wir erweitern vorhandene klinische Informationssysteme mit wissensverarbeitenden Funktionen und strukturieren die anfallende Informationsflut mit dem Ziel der Konzeption und Etablierung innovativer IT-Infrastrukturen für die klinische Forschung und der Wiederverwendung von Daten aus der elektronischen Krankenakte für die medizinische Forschung.

Am Uniklinikum Erlangen wurde im Rahmen des MIRACUM-Projekts (BMBF Medizininformatik-Initiative) gemeinsam mit dem Lehrstuhl für Med. Informatik ein Datenintegrationszentrum (DIZ) aufgebaut, das Daten aus der Routineversorgung für die Forschung verfügbar macht.
Im Projekt "MIRACUM DIFUTURE Alignment Hub“ (MIDIA-Hub) wird mit Hilfe des Projektpartners Siemens Healthcare GmbH eine Versorgungs- und Forschungsstruktur zusammen mit der TU München implementiert. MIDIA-Hub möchte die sektorübergreifenden Kommunikationsprozesse zwischen Unikliniken und niedergelassenen Ärzten optimieren und die Patienten stärker in den Versorgungsprozess und die klinische Forschung einbinden.
Bei DigiOnko wird die Patientin von Beginn ihrer Situation an durch ein Kompetenzteam unterstützt. In diesem arbeiten Ärzt:innen, Therapeut:innen und alle an der Versorgung beteiligten Einrichtungen wie beispielsweise Praxen, Kliniken, Pflegedienste oder Nachsorge-Einrichtungen zusammen, um eine optimale Unterstützung zu gewährleisten. Dabei werden Methoden der digitalen Medizin und reale Betreuungsstrukturen – Stichwort Digitale Pathologie und Digital Home Healthcare Center – vernetzt und greifen so perfekt ineinander.

Die Aufgaben

- Integration der IT-Systeme des UK Erlangen mit der Infrastruktur des Projektpartners unter Verwendung IHE-konformer Schnittstellen
- Parametrierung und Entwicklung IHE-konformer Schnittstellen in Zusammenarbeit mit den Teams des Bilddatenmanagements, Kommunikationsservers und Datenintegrationszentrums am UK Erlangen
- Integration und Harmonisierung der über MIDIA-Hub und DigiOnko gesammelten Daten in die Forschungsrepositories des Erlanger DIZ
- Mitarbeit in Projekten zur Erschließung und Integration weiterer klinischer Daten aus Routinesystemen des UK Erlangen
- Unterstützung beim Aufbau des Patientenportals am UK Erlangen
- Koordination mit den Projektpartnern

Das Know-how dafür

- Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium als M.Sc. der Medizintechnik, Medizinischen Informatik, Informatik oder eines verwandten Studiengangs
- Kenntnisse in Java
- Kenntnisse in HL7 FHIR
- Hohe Motivation, Fähigkeit zu eigenständiger Problemlösung sowie Bereitschaft zu selbstständiger Einarbeitung in neue Aufgaben mit entsprechender Weiterbildung
- Analytisches Denkvermögen, Organisationsfähigkeit, Teamfähigkeit, Lernbereitschaft, Kommunikationsfähigkeit, offenes und kommunikatives Auftreten

Zusätzlich von Vorteil

- Wünschenswert sind Kenntnisse in IHE
- Wünschenswert sind Kenntnisse von Prozessabläufen im klinischen Umfeld
- Wünschenswert sind Kenntnisse von medizinischen Terminologien

Bemerkungen

- Es handelt sich um eine Vollzeitstelle, Teilzeit ist nach Absprache möglich.
- Die Stelle ist befristet (24 Monate)
- Frühestmöglicher Einstellungstermin: nächstmöglich
- Bewerbungsfrist: 30.11.2023
- Hinweise für Ihre Bewerbung ( http://www.uker.de/hinweisefuerbewerber )

Das bieten wir:

- Einen krisensicheren Arbeitsplatz mit allen Annehmlichkeiten eines Tarifvertrages, inkl. Zusatzvorsorge der Versorgungsanstalt des Bundes und der Länder (VBL), bei uns als systemrelevanter Arbeitgeber im öffentlichen Dienst
- Eine interessante Tätigkeit in einem motivierten, aufgeschlossenen Team
- Sorgfältige und qualifizierte Einarbeitung
- Ein umfassendes Angebot zur Gesundheitsförderung
- Beabsichtigte Eingruppierung, je nach Qualifikation und persönlichen Voraussetzungen, gemäß TV-L
- Es handelt sich um eine Vollzeitstelle, Teilzeit ist nach Absprache möglich.

Ansprechperson bei Fragen:

Dr. Detlef Kraska
Telefon: 09131 85-46400

Bewerbung an:

Universitätsklinikum Erlangen
Medizinisches IK-Zentrum
Herrn Martin Schneider
Krankenhausstraße 12
91054 Erlangen